中大新聞網(wǎng)訊(通訊員簡文楊、戴希安、高峰)CT作為一種常見的檢查手段,相信不少老百姓均十分熟悉。而基于影像的自動分割技術(shù)能夠輔助醫(yī)生精確了解病灶的位置、大小以及與周圍血管、組織的關(guān)系,幫助疾病診斷、圖像引導手術(shù)以及醫(yī)學數(shù)據(jù)的可視化,為臨床診療和病理學研究提供可靠的依據(jù)。當前,能否實現(xiàn)全自動的、精準的病灶分割是決定醫(yī)學影像在臨床使用效果的關(guān)鍵。
近年來,深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的快速發(fā)展使得許多先進的分割方法都取得了可喜的進展。但與肝臟、心臟等器官相比,腸道腫瘤的形態(tài)、位置的變化大,因此,腸道腫瘤的自動分割任務難度高。特別是結(jié)腸癌,因病灶分布范圍大、解剖結(jié)構(gòu)復雜,一直未能實現(xiàn)有效的病灶自動分割,這一現(xiàn)狀嚴重制約了腸癌精準診療人工智能的臨床應用。
近日,中山大學附屬第六醫(yī)院結(jié)直腸肛門外科吳小劍團隊邁出了堅實的一步。他們在國際上率先實現(xiàn)了自主結(jié)腸癌病灶影像精準分割的人工智能臨床解決方案,源于其開發(fā)的結(jié)腸癌病灶自動精準分割的醫(yī)學影像人工智能弱監(jiān)督-半監(jiān)督框架(Segmentation Only Uses Sparse Annotations,SOUSA )。相關(guān)研究結(jié)果在醫(yī)學影像人工智能算法頂刊Medical Image Analysis(IF=13.828)發(fā)表。
本研究由吳小劍教授團隊牽頭,聯(lián)合喀什地區(qū)第一人民醫(yī)院(以下簡稱“喀地一院”)鄒小廣教授團隊、上海人工智能實驗室協(xié)作完成。
論文題為“Segmentation only uses sparse annotations: Unified weakly and semi-supervised learning in medical images”(只使用稀疏標注的病灶分割:醫(yī)學圖像的聯(lián)合弱學習和半監(jiān)督學習),吳小劍教授為最后通訊作者,喀地一院鄒小廣教授、上海交通大學張曉凡教授為共同通訊作者,中山大學附屬第六醫(yī)院高峰副研究員、鐘敏兒博士、孟曉春主任與喀地一院田序偉主任為共同第一作者,喀地一院馬依迪麗·尼加提主任等為共同作者。
基于CT影像的結(jié)腸癌病灶分割
據(jù)介紹,基于醫(yī)學影像的人工智能為腸癌個體化診療提供了巨大的可能性,已經(jīng)有多項研究實現(xiàn)了病人的療效預測、術(shù)后復發(fā)風險評估,但這些應用無不依賴于精準的病灶分割。此次SOUSA技術(shù)的開發(fā)在國際上首次實現(xiàn)了結(jié)腸癌的自動分割,為加速腸癌人工智能精準診療的臨床應用奠定了基礎(chǔ)。自動化標準化的精準影像信息處理將有效地降低經(jīng)濟、時間和人力成本,為精準診療的實施提供了重要的臨床依據(jù),具備極大的臨床轉(zhuǎn)化應用前景。
本研究中,團隊在SOUSA框架中充分利用了弱監(jiān)督學習和半監(jiān)督學習的優(yōu)勢,提高了人工智能的學習效率,減少了假陽性的預測,顯著提高了病灶分割的準確度。
SOUSA框架
團隊利用來自中山大學附屬第六醫(yī)院和喀地一院的923例有標注結(jié)腸癌CT影像和2670例無標注結(jié)腸癌CT影像作為SOUSA框架的訓練數(shù)據(jù)集,并利用417例結(jié)腸癌CT影像對SOUSA框架進行驗證,結(jié)果顯示其自動分割效果優(yōu)于現(xiàn)有的弱監(jiān)督和半監(jiān)督學習模型。與目前最先進的方法ICT (Verma et al.,2019)、不確定性感知(Yu et al.,2019)和自我訓練相比,SOUSA框架在每個數(shù)據(jù)比率上都達到了最佳性能。此外,當數(shù)據(jù)集的大小有限時,SOUSA框架的性能甚至與使用密集注釋的模型的性能相當。
對腸癌數(shù)據(jù)集使用不同方法的自動分割結(jié)果
受中山大學選派,自2021年6月27日起,現(xiàn)任廣東省援疆醫(yī)療隊隊長、喀地一院院長、中山大學附屬第六醫(yī)院副院長吳小劍投身為期一年半的援疆工作。援疆期間,吳小劍立足當?shù)貙W科建設(shè),發(fā)揮該院團隊特長,以SOUSA框架這一粵喀合作成果切實助力喀地一院發(fā)展。
論文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.media.2022.102515