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中山大學(xué)姚成果課題組與廈門大學(xué)葉從庭課題組合作報道U4 snRNP維持全長pre-mRNA轉(zhuǎn)錄完整性的分子生物學(xué)功能

稿件來源:中山醫(yī)學(xué)院 編輯:談希、盧旖維 審核:孫耀斌 閱讀量:

中大新聞網(wǎng)訊(通訊員張玉琦)在生化教科書中,U1 snRNP與U4 snRNP的分子生物學(xué)功能是真核生物中參與pre-mRNA splicing。2010年,Gideon Dreyfuss實驗室發(fā)現(xiàn)U1 snRNP具有維持新生全長pre-mRNA轉(zhuǎn)錄的新功能,并命名為U1 snRNP telescripting。2023年,中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院干細(xì)胞中心姚成果課題組與廈門大學(xué)葉從庭課題組合作在國際生化領(lǐng)域權(quán)威雜志JBC發(fā)表更新了U1 snRNP telescripting的分子機制模型(2023, JBC),但U1 snRNP telescripting究竟是否與U1的經(jīng)典splicing功能相關(guān)尚不明確。

2024年6月26日,中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院干細(xì)胞中心姚成果課題組與廈門大學(xué)葉從庭課題組繼續(xù)針對U1 snRNP telescripting分子機制的核心問題深耕挖掘,在國際頂級期刊《PNAS》上發(fā)表了題為‘U4 snRNP inhibits premature cleavage and polyadenylation of pre-mRNAs’的學(xué)術(shù)論文,報道了針對領(lǐng)域內(nèi)這一重難點問題的最新研究成果。這是該課題組近年在mRNA長度調(diào)控領(lǐng)域的重要進展 (2017, NAR; 2018,2019,2021,2022, RNA Biol.; 2020, BBRC; 2023, JBC)。

為了探討U1 snRNP telescripting現(xiàn)象是否與U1 splicing相關(guān),他們針對splicing復(fù)合體中的另一重要復(fù)合體U4 snRNP進行功能失活實驗。通過設(shè)計特異性針對U4 snRNA的反義核酸(antisense morpholino oligo, AMO)和細(xì)胞內(nèi)實驗,他們發(fā)現(xiàn)U4 AMO在體外和細(xì)胞內(nèi)都可以特異性的功能失活U4 snRNP。通過3’-seq實驗,發(fā)現(xiàn)U1與U4 AMO處理都能引起內(nèi)含子內(nèi)數(shù)以萬計的cryptic polyadenylation site (PAS)激活,從而使得pre-mRNA變短(>4000基因)。這個結(jié)果直接證明了U1 snRNP telescripting現(xiàn)象并不是U1所獨有的,從而推翻了之前Dreyfuss實驗室的諸多觀點。

此項研究對于共轉(zhuǎn)錄加工的分子機制研究意義深遠(yuǎn)。鑒于U1與U4在splicing過程中的核心作用,這是首次直接用更有說服力的實驗證據(jù)表明,很有可能是整個splicing過程抑制了cryptic PAS的利用,從而防止premature cleavage and polyadenylation (PCPA)和premature transcription termination (PTT)。這個假說有望為分子生物學(xué)中心法則下的真核基因調(diào)控表達(dá)增添新的內(nèi)容:即splicing的另一普適性新功能,是防止基因轉(zhuǎn)錄提前PCPA, 從而預(yù)防過早轉(zhuǎn)錄終止(premature transcription termination, PTT)。值得一提的是,該論文從提交到接受僅用41天,側(cè)面表明編輯和審稿人對研究結(jié)果的高度認(rèn)可。

中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院研究生馮秋敏、趙丹慧、林則瑾是論文的共同第一作者,廈門大學(xué)葉從庭副教授是論文的共同通訊作者,中山大學(xué)姚成果副教授是論文的主要通訊作者。該研究得到了多項基金,包括國家自然科學(xué)基金面上項目和廣東省自然科學(xué)基金面上項目的資助。

原文鏈接 www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2406710121

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