11月3日，我校附屬第一醫(yī)院病理科柯尊富主任醫(yī)師肺癌研究團(tuán)隊(duì)在Clinical Cancer Research (IF 2017=10.19）期刊上發(fā)表了研究性論文Development and validation of a novel signature to predict overall survival in “driver-gene-negative” lung adenocarcinoma (LUAD): results of a multicenter study(online first),附屬第一醫(yī)院為唯一通訊單位，第一作者為呼吸與危重癥醫(yī)學(xué)科唐可京副教授、研究助理崔詠梅。
CSDW建模過(guò)程
該研究旨在探索發(fā)育組信號(hào)通路在驅(qū)動(dòng)基因陰性肺腺癌中的作用，并探尋與驅(qū)動(dòng)基因陰性肺腺癌患者預(yù)后顯著相關(guān)的分子，以期為此類(lèi)預(yù)后差的病人提供新的治療靶點(diǎn)。實(shí)驗(yàn)分為3大部分：發(fā)現(xiàn)階段、實(shí)驗(yàn)階段以及驗(yàn)證階段。在發(fā)現(xiàn)階段，課題組利用全基因組芯片對(duì)52對(duì)驅(qū)動(dòng)基因陰性肺腺癌腫瘤組織和相鄰正常組織進(jìn)行候選基因的篩選，通過(guò)KEGG信號(hào)通路富集分析發(fā)現(xiàn)Wnt/β-catenin信號(hào)通路在驅(qū)動(dòng)基因陰性肺腺癌中高度激活，并得到41個(gè)Wnt/β-catenin信號(hào)通路相關(guān)的差異表達(dá)基因。在實(shí)驗(yàn)階段，課題組運(yùn)用組織芯片技術(shù)(TMAs)和LASSO Cox回歸分析進(jìn)一步對(duì)41個(gè)候選基因進(jìn)行篩選，最終構(gòu)建了一個(gè)由CTNNB1、SOX9、DVL3和Wnt2b組成的預(yù)后相關(guān)classifier（CSDW）。依據(jù)CSDW classifier,驅(qū)動(dòng)基因陰性肺腺癌患者可被分為高風(fēng)險(xiǎn)組和低風(fēng)險(xiǎn)組，并且高風(fēng)險(xiǎn)患者的總生存率顯著差于低風(fēng)險(xiǎn)患者（[HR]10.42,6.46-16.79;p<0 .001）。在驗(yàn)證階段，課題組收集了內(nèi)部驗(yàn)證組樣本和兩個(gè)獨(dú)立的外部驗(yàn)證組樣本。經(jīng)過(guò)驗(yàn)證分析，csdw classifier被證實(shí)可作為預(yù)測(cè)驅(qū)動(dòng)基因陰性肺腺癌患者預(yù)后的可靠工具，同時(shí)為驅(qū)動(dòng)基因陰性肺腺癌的治療提供新的靶點(diǎn)。
該項(xiàng)研究工作得到附屬第一醫(yī)院“三個(gè)三”工程項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目、廣東省自然科學(xué)基金的資助。
論文鏈接：http://clincancerres.aacrjournals.org/content/early/2018/11/02/1078-0432.CCR-18-2545.long
