為加強醫院臨床專科能力建設，國家衛生計生委于2010年啟動國家臨床重點專科建設項目評估工作。根據《國家衛生計生委辦公廳關于確定2013-2014年度國家臨床重點專科建設項目單位的通知》（國衛辦醫函〔2013〕544號），我校附屬第一醫院、孫逸仙紀念醫院、附屬第三醫院、附屬腫瘤醫院、附屬口腔醫院共有17個專科通過評審，被確定為2013-2014年度國家臨床重點專科建設項目。

在此輪國家臨床重點專科建設項目評估工作中，我校附屬醫院共有52個專科被列入國家臨床重點專科建設項目，占廣東省獲評總數近一半（廣東省共獲評106個建設項目）。其中，附屬第一醫院共有28個專科入選該建設項目，為全國獲得這一建設項目數量最多的三甲醫院之一。