中大新聞網(wǎng)訊(通訊員芎林啊)原核生物包括了細(xì)菌和古菌,它們在生物圈中無處不在,并參與和驅(qū)動各種生物和環(huán)境過程。人體和動物相關(guān)的原核微生物在宿主消化、免疫和神經(jīng)發(fā)育等多個(gè)過程中發(fā)揮重要作用。環(huán)境中的微生物則在物質(zhì)循環(huán)和能量流動中扮演著多種重要的功能角色。原核生物的系統(tǒng)學(xué)對認(rèn)識原核生物的多樣性、進(jìn)化過程以及功能特征都具有重要意義,同時(shí)原核生物系統(tǒng)學(xué)也是微生物學(xué)科學(xué)傳播和交流中的重要和必要的環(huán)節(jié)。
近日,生命科學(xué)學(xué)院李文均教授課題組在國際知名學(xué)術(shù)期刊National Science Review上發(fā)表題為“Advancements in prokaryotic systematics and the role of Bergey's International Society for Microbial Systematics in addressing challenges in the meta-data era”的綜述論文(圖1)。
圖1原核生物系統(tǒng)學(xué)發(fā)展的里程碑
本文綜述了原核生物系統(tǒng)學(xué)的發(fā)展與歷史進(jìn)展,以及BMSAB和BISMiS在這方面所做的貢獻(xiàn),探討了微生物系統(tǒng)學(xué)取得的重大成就和進(jìn)步,總結(jié)該領(lǐng)域的最新進(jìn)展。原核生物系統(tǒng)學(xué)的起源可以追溯到17世紀(jì),它經(jīng)歷了從基于基本表型的分類到基于生理、生化等復(fù)雜特征的多相分類的轉(zhuǎn)變,并最終發(fā)展到目前的基于整體生理、生化與基因組的現(xiàn)代系統(tǒng)分類。在這過程中,伯杰氏國際微生物系統(tǒng)學(xué)學(xué)會(Bergey's International Society for Microbial Systematic,BISMiS)和伯杰氏細(xì)菌和古菌系統(tǒng)學(xué)手冊(Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria,BMSAB)在指導(dǎo)和規(guī)范原核微生物系統(tǒng)學(xué)研究方面發(fā)揮了關(guān)鍵作用。此外,本文展望原核生物系統(tǒng)學(xué)存在的4個(gè)挑戰(zhàn)和機(jī)遇,旨在提供對微生物系統(tǒng)學(xué)的歷史、現(xiàn)狀和未來的見解,并為該領(lǐng)域的學(xué)者提供參考。本文還概述了應(yīng)對這些挑戰(zhàn)的的五點(diǎn)建議,期望通過加強(qiáng)原核系統(tǒng)學(xué)的持續(xù)發(fā)展,確保其在基因組學(xué)和生物信息學(xué)時(shí)代的創(chuàng)新性。
中山大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院焦建宇副研究員和中科院新疆生態(tài)與地理研究所熱西丁·阿不都艾尼博士作為本文共同第一作者,中山大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院李文均教授為通訊作者。河海大學(xué)張道鋒博士、巴基斯坦農(nóng)業(yè)研究中心的Iftikhar Ahmed研究員、中山大學(xué)Mukhtiar Ali博士、昆士蘭大學(xué)的Maria Chuvochina博士、俄羅斯科學(xué)院生物技術(shù)研究中心的Svetlana N. Dedysh教授、中國科學(xué)院微生物研究所的東秀珠研究員、德國萊布尼茨研究所微生物和細(xì)胞培養(yǎng)保藏中心(DSMZ)的Markus G?ker博士、美國內(nèi)華達(dá)大學(xué)的Brian P. Hedlund教授、昆士蘭大學(xué)的Philip Hugenholtz教授、印度Agharkar研究所的Kamlesh Jangid研究員、中國科學(xué)微生物研究所/山東大學(xué)的劉雙江教授、瑞典哥德堡大學(xué)薩爾格倫斯卡學(xué)院的Edward R.B. Moore教授、智利自治大學(xué)工程學(xué)院應(yīng)用科學(xué)研究所Manik Prabhu Narsing Rao博士、以色列希伯來大學(xué)的Aharon Oren教授、西班牙地中海高級研究所的Ramon Rossello-Mora教授、印度Yenepoya 研究中心Bhagwan Narayan Rekadwad博士、印度國家農(nóng)業(yè)食品生物技術(shù)研究所Nimaichand Salam博士、華南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院束文圣教授、英國諾森比亞大學(xué)健康與生命科學(xué)學(xué)院Iain C. Sutcliffe教授、馬來亞大學(xué)理學(xué)院Wee Fei Aaron Teo博士、西班牙薩拉曼卡大學(xué)微生物學(xué)和遺傳學(xué)系Martha E. Trujillo教授、南非比勒陀利亞大學(xué)生物化學(xué)Stephanus N. Venter教授、美國佐治亞大學(xué)微生物學(xué)系William B. Whitman教授和中國科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院合成生物學(xué)研究所趙國平院士為本文的共同作者。中山大學(xué)為該成果的第一完成單位。該研究工作得到國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃,國家自然科學(xué)基金,廣東省科技計(jì)劃項(xiàng)目,新疆維吾爾自治區(qū)“天池英才-青年博士”人才引進(jìn)計(jì)劃和國家博士后面上項(xiàng)目支持。