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生命科學學院李文均教授團隊系統綜述了原核生物系統學最新進展及伯杰氏國際系統微生物學學會(BISMiS)在元數據時代應對挑戰中的角色

稿件來源:生命科學學院 編輯:談希、盧旖維 審核:孫耀斌 閱讀量:

中大新聞網訊(通訊員芎林啊)原核生物包括了細菌和古菌,它們在生物圈中無處不在,并參與和驅動各種生物和環境過程。人體和動物相關的原核微生物在宿主消化、免疫和神經發育等多個過程中發揮重要作用。環境中的微生物則在物質循環和能量流動中扮演著多種重要的功能角色。原核生物的系統學對認識原核生物的多樣性、進化過程以及功能特征都具有重要意義,同時原核生物系統學也是微生物學科學傳播和交流中的重要和必要的環節。

近日,生命科學學院李文均教授課題組在國際知名學術期刊National Science Review上發表題為“Advancements in prokaryotic systematics and the role of Bergey's International Society for Microbial Systematics in addressing challenges in the meta-data era”的綜述論文(1)。

1原核生物系統學發展的里程碑

本文綜述了原核生物系統學的發展與歷史進展,以及BMSAB和BISMiS在這方面所做的貢獻,探討了微生物系統學取得的重大成就和進步,總結該領域的最新進展。原核生物系統學的起源可以追溯到17世紀,它經歷了從基于基本表型的分類到基于生理、生化等復雜特征的多相分類的轉變,并最終發展到目前的基于整體生理、生化與基因組的現代系統分類。在這過程中,伯杰氏國際微生物系統學學會(Bergey's International Society for Microbial Systematic,BISMiS)和伯杰氏細菌和古菌系統學手冊(Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria,BMSAB)在指導和規范原核微生物系統學研究方面發揮了關鍵作用。此外,本文展望原核生物系統學存在的4個挑戰和機遇,旨在提供對微生物系統學的歷史、現狀和未來的見解,并為該領域的學者提供參考。本文還概述了應對這些挑戰的的五點建議,期望通過加強原核系統學的持續發展,確保其在基因組學和生物信息學時代的創新性。

中山大學生命科學學院焦建宇副研究員和中科院新疆生態與地理研究所熱西丁·阿不都艾尼博士作為本文共同第一作者,中山大學生命科學學院李文均教授為通訊作者。河海大學張道鋒博士、巴基斯坦農業研究中心的Iftikhar Ahmed研究員、中山大學Mukhtiar Ali博士、昆士蘭大學的Maria Chuvochina博士、俄羅斯科學院生物技術研究中心的Svetlana N. Dedysh教授、中國科學院微生物研究所的東秀珠研究員、德國萊布尼茨研究所微生物和細胞培養保藏中心(DSMZ)的Markus G?ker博士、美國內華達大學的Brian P. Hedlund教授、昆士蘭大學的Philip Hugenholtz教授、印度Agharkar研究所的Kamlesh Jangid研究員、中國科學微生物研究所/山東大學的劉雙江教授、瑞典哥德堡大學薩爾格倫斯卡學院的Edward R.B. Moore教授、智利自治大學工程學院應用科學研究所Manik Prabhu Narsing Rao博士、以色列希伯來大學的Aharon Oren教授、西班牙地中海高級研究所的Ramon Rossello-Mora教授、印度Yenepoya 研究中心Bhagwan Narayan Rekadwad博士、印度國家農業食品生物技術研究所Nimaichand Salam博士、華南師范大學生命科學學院束文圣教授、英國諾森比亞大學健康與生命科學學院Iain C. Sutcliffe教授、馬來亞大學理學院Wee Fei Aaron Teo博士、西班牙薩拉曼卡大學微生物學和遺傳學系Martha E. Trujillo教授、南非比勒陀利亞大學生物化學Stephanus N. Venter教授、美國佐治亞大學微生物學系William B. Whitman教授和中國科學院深圳先進技術研究院合成生物學研究所趙國平院士為本文的共同作者。中山大學為該成果的第一完成單位。該研究工作得到國家重點研發計劃,國家自然科學基金,廣東省科技計劃項目,新疆維吾爾自治區“天池英才-青年博士”人才引進計劃和國家博士后面上項目支持。

論文鏈接:https://doi.org/10.1093/nsr/nwae168

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